این واحد در راستای وظایف سازمانی حوزه معاونت برنامه ریزی وظایف خطیر و عمده ای را تقبل و در این خصوص، ساختار آن براساس نیاز های سازمانی و بشکل زیر تعریف شده است:
-گروه برنامه ریزی بودجه
-بخش برنامه ریزی و تخصیص آب و اقتصاد آب اهم وظایف مدیریت برنامه ریزی و بررسی های اقتصادی : مشارکت در تهیه و تدوین برنامه های کوتاه مدت ، میان مدت و بلند مدت آب - ایجاد هماهنگی با دفتر ذیربط شرکت مدیریت منابع آب ایران ، وزارت نیرو ، سازمان برنامه و بودجه کشور برای تسهیل برنامه ریزی و ارسال و دریافت اطلاعات و مبادله قوانین ، دستورالعمل ها و آئین نامه های اجرائی مربوط به مدیریت برنامه ریزی آب - برنامه ریزی ، هماهنگی و نظارت بر انجام فعالیتهای جاری و عمرانی - مدیریت منابع و مصارف و تخصیص بهینه آب - تهیه و تنظیم بودجه سالانه شرکت - تدوین ، ابلاغ و نظارت بر عملکرد بودجه - بررسی و نظارت بر پیشرفت برنامه های جاری و پروژه های عمرانی - بررسیهای اقتصادی طرحهای در دست اجرا و بهره برداری شده به منظور ارتقاء شاخصهای بهره وری و تقویت بنیه اقتصادی شرکت.
